สินค้า

เมื่อเร็ว ๆ นี้เราได้รายงานว่า pyrene nucleotide ถูกแทรกอย่างพิเศษตรงข้ามไซต์ที่เป็นเบสิก 3'-T ของ thymine dimer และเบสที่ไม่เสียหายส่วนใหญ่โดย DNA polymerase eta ของยีสต์ (pol eta)เนื่องจากไพรีนเป็นโมเลกุลไม่มีขั้วที่ไม่มีพันธะ H ประสิทธิภาพที่สูงผิดปกติของการแทรก dPMP จึงถูกกำหนดให้เป็นความสามารถในการเรียงซ้อนฐานที่เหนือกว่า และเน้นย้ำถึงความสำคัญของการเรียงซ้อนฐานในการเลือกนิวคลีโอไทด์โดย pol etaในการตรวจสอบบทบาทของการสร้างพันธะ H และเรขาคณิตของคู่เบสในการเลือกนิวคลีโอไทด์โดย pol eta เราได้พิจารณาประสิทธิภาพการแทรกของนิวคลีโอไทด์ที่ดัดแปลงฐาน 2,6-diaminopurine, 2-aminopurine, 6-chloropurine และ inosine ซึ่งจะ สร้างพันธะ H ในจำนวนที่แตกต่างกันด้วยฐานแม่แบบขึ้นอยู่กับรูปทรงเรขาคณิตของคู่ฐานการจับคู่ฐานของวัตสัน-คริกดูเหมือนจะมีบทบาทสำคัญในการเลือกอะนาล็อกของนิวคลีโอไทด์สำหรับการแทรกตรงข้าม C และ T ดังที่เห็นได้จากประสิทธิภาพการแทรกสัมพัทธ์ที่ลดลงโดยมีจำนวนพันธะ H ของวัตสัน-คริกลดลงและการเพิ่มขึ้นของ จำนวนการโต้ตอบระหว่างผู้บริจาคและผู้บริจาคและผู้รับ-ผู้รับหัวกะทิของการแทรกนิวคลีโอไทด์นั้นตรงข้ามกับ 5'-T มากกว่า 3'-T ของไทมีนไดเมอร์ ซึ่งสอดคล้องกับงานก่อนหน้านี้ที่แนะนำว่า 5'-T ถูกยึดอย่างเข้มงวดมากกว่า 3'-Tนอกจากนี้ การใส่ A ตรงข้าม Ts ทั้งสองของ dimer ดูเหมือนจะถูกสื่อกลางโดยการจับคู่ฐานของ Watson-Crick และไม่ใช่โดยการจับคู่ฐานของ Hoogsteen ตามประสิทธิภาพการแทรกที่เกือบจะเหมือนกันของ A และ 7-deaza-A ซึ่งอย่างหลังไม่มี H- ความสามารถในการยึดติดที่ N7ประสิทธิภาพสัมพัทธ์สำหรับการแทรกนิวคลีโอไทด์ที่สามารถสร้างคู่เบสของวัตสัน-คริกขนานกับชิ้นส่วนของ Klenow ในขณะที่ชิ้นส่วนของ Klenow แยกแยะได้ชัดเจนยิ่งขึ้นกับความไม่ตรงกัน ซึ่งสอดคล้องกับการเลือกรูปร่างที่มากขึ้นผลลัพธ์เหล่านี้เน้นย้ำถึงความสำคัญของการสร้างพันธะ H และเรขาคณิตคู่เบสของ Watson-Crick ในการเลือกนิวคลีโอไทด์โดยทั้ง pol eta และชิ้นส่วน Klen ow และการเลือกรูปร่างที่มีบทบาทน้อยลงในการแทรกโดย pol eta เนื่องจากมีการเปิดมากขึ้นและน้อยลง ไซต์ที่ใช้งานอยู่มีข้อจำกัด